أدى اعتصام طلاب جامعة الخرطوم المستمر منذ أكثر من أسبوعين، إلى خلافات عميقة بين الأجهزة الأمنية الحكومية تبلورت عشية أول من أمس في ملاسنات حادة نشبت بين منسوبي جهاز الأمن الوطني وضابط برتبة كبيرة من الشرطة، قبيل لحظات من اقتحام طلاب ينتمون للمؤتمر الوطني للحرم الجامعي في محاولة لفض الاعتصام بالقوة، في الوقت الذى علقت إدارة الجامعة الدراسة في بعض الكليات. وطبقاً لمصادر تحدثت لـالوطن فإن الشرطة حاولت منع بعض الطلاب الذين تجمعوا خارج الجامعة وهم يحملون السواطير والعصي، من الدخول إلى مقر الجامعة التي يتخندق بداخلها الطلاب المعتصمين غير أن بعض منسوبي جهاز الأمن منعوا أفراد الشرطة من اعتقال الطلاب المهاجمين والذين ينتمون للمؤتمر الوطني.
وكان عدد من طلاب جامعة الخرطوم قد نددوا بممارسات طلاب ينتمون للمؤتمر الوطني الذي يترأسه الرئيس السوداني عمر البشير، والتي أدت لنشوء أحداث عنف في الجامعة خلفت جرحى بأعداد كثيرة من الطلاب.